(-)-曲古柳菌素 A 是一种 HDAC6 选择性抑制剂，对斑马鱼 HDAC6 和人 HDAC6 的 IC₅₀ 值分别为 9.88 nM和 11.1 nM。(S)-Trichostatin A 弱抑制其他人 HDAC。                                                                                                                      

SKLB-23bb 是一种有效的选择性 HDAC6 抑制剂，IC50 为 17 nM，比抑制 HDAC1 (IC50= 422 nM) 和 HDAC8 (IC50=3398 nM) 选择性分别高 25 倍和 200 倍。

Tubacin 是一种有效的，选择性的 HDAC6 抑制剂，IC50 值为 4 nM，大约是对 HDAC1 的350倍。

CAY10398 是组蛋白去乙酰化酶（HDAC1）抑制剂，IC50 为10µM。

Tucidinostat 是一种有效的，可口服的 HDAC 第 I 类 HDAC1/2/3 和第 IIb 类 HDAC10 的抑制剂，IC50 值分别为 95，160，67 和 78 nM，对 HDAC8 和 HDAC11 的作用较弱 (IC50，733 nM，432 nM)，对 HDAC4/5/6/7/9 无作用。

CXD101 是一种有效的，选择性的，具有口服活性的 I 类 HDAC 抑制剂，对 HDAC1，HDAC2 和 HDAC3 的 IC₅₀ 分别为 63 nM，570 nM 和 550 nM。Zabadinostat 对 II 类 HDAC 没有活性，并具有抗肿瘤活性。

Boc-Lys(Ac)-AMC 是一种可渗透细胞的荧光 HDAC 底物 (Ex/Em = 355 nm/460 nm)。                                                                                                                      

MI-192 是一种选择性HDAC2和HDAC3抑制剂，IC50分别为30 nM和16 nM。MI-192 比其他HDAC异构体对HDAC2/3更具选择性，可诱导髓系白血病细胞凋亡，有抗肿瘤和神经保护活性。

Resminostat 是一种有效的 HDAC1，HHDAC3 和 HDAC6 抑制剂，IC50 值分别为 42.5，50.1，71.8 nM，同时对 HDAC8 有较弱的抑制作用，IC50 值为 877 nM。